הרב אליהו בקשי דורון נדבק בנגיף הקורונה, לפני חמישה ימים, ולאחר מאבק הרופאים בשערי צדק נאלצו לקבוע את מותו. הרב הלך לעולמו בגיל 79, היה הרב הראשי לישראל בין השנים 1993–2003. הרב שימש לאורך השנים בתפקידים שונים ברבנות בישראל בין היתר רב העיר בת ים, רב העיר חיפה וכנשיא המוסדות "בנין אב".
הרב חיבר סדרת ספרי הלכה הנושאים גם כן את השם "בנין אב" עליהם זכה בפרסים. טרם הוחלט מתי הרב יובל למנוחות, בכוחות הביטחון חוששים, שרבים ירצו לקחת חלק בהלוויתו.
מבית החולים שערי צדק נמסר: "הראשון לציון הרב אליהו בקשי דורון זצ"ל נפטר בדקות האחרונות במחלקה לחולי קורונה במרכז הרפואי שערי צדק. הרב אושפז לפני מספר ימים לאחר שאובחן כחיובי לקורונה. מצבו של הרב שסבל ממחלות רקע מורכבות הדרדר במהלך היום ולמרות מאמצי החייאה רבים בשעה האחרונה, נאלצו הרופאים לקבוע את מותו. אנו משתתפי בצער משפחתו ותלמידיו הרבים בארץ ובעולם".
השר אריה דרעי הגיב לפטירתו של הרב: "ברוך דיין האמת. מתאבל מרה על פטירת הרב הראשי, הראשון לציון, הרב אליהו בקשי דורון. הרב בקשי דורון, היה תלמיד חכם ענק, מורה דרך לרבים בעם ישראל ופטירתו היא מכה גדולה. כאב גדול מאד, אבדה גדולה לעם ישראל. יהי זכרו ברוך"